Desarrollo y caracterización de marcadores moleculares SSR para Trichloris crinita usando secuencias de gramíneas filogenéticamente cercanas

Autores/as

  • Perla Carolina Kozub Universidad Nacional de Cuyo (UNCuyo). Facultad de Ciencias Agrarias (FCA). Instituto de Biología Agrícola de Mendoza (IBAM). Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Almirante Brown 500. Chacras de Coria. Mendoza M5528AHB. Argentina
  • Karina Barboza Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) E.E.A. La Consulta. Ex ruta 40 Km 96. San Carlos. Mendoza 5567. Argentina
  • Juan Bruno Cavagnaro Universidad Nacional de Cuyo (UNCuyo). Facultad de Ciencias Agrarias (FCA). Instituto de Biología Agrícola de Mendoza (IBAM). Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Almirante Brown 500. Chacras de Coria. Mendoza M5528AHB. Argentina
  • Pablo Federico Cavagnaro Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) E.E.A. La Consulta. Ex ruta 40 Km 96. San Carlos. Mendoza 5567. Argentina

Palabras clave:

Chloridoideae, gramínea forrajera, diversidad genética, transferibilidad, microsatélites

Resumen

Trichloris crinita es una importante gramínea forrajera, nativa de regiones áridas del continente americano. A pesar de su importancia, no existen herramientas moleculares ni secuencias nucleotídicas disponibles para esta especie. En este estudio, se desarrollaron marcadores moleculares SSR ("simple sequence repeats") a partir de secuencias nucleotídicas de especies filogenéticamente cercanas a Trichloris (Eleusine coracana, Cynodon dactylon y ‘Cynodon dactylon x Cynodon transvaalensis’) y se evaluó su transferibilidad en ocho accesiones de T. crinita y cinco especies de gramíneas cercanamente emparentadas. De los 105 pares de cebadores evaluados, 16 amplificaron productos del tamaño esperado en T. crinita, mientras que la transferibilidad a otras especies varió entre 12 (en Chloris castilloniana) y 28 SSRs (en Eleusine coracana). De los 16 SSRs transferibles a T. crinita, seis fueron polimórficos y se utilizaron para analizar el grado de diversidad genética en ocho accesiones de esta especie. El análisis reveló 23 alelos, los cuales permitieron diferenciar todas las accesiones de T. crinita, con valores de similitud genética entre pares de accesiones de 0,35 a 0,81 (Jaccard). Se obtuvieron valores medios de heterocigosidad observada y esperada de 0,53 y 0,63 respectivamente.

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Publicado

01-07-2018

Número

Sección

Genética y mejoramiento vegetal