FTIR Analysis of colagen preservation and possible contamination in Quaternary bones samples from the Pampas

Authors

  • Paula Vitale Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano, Facultad de Ciencias Sociales. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires, Facultad de Ingeniería. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires
  • Julia Tasca Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Física e Ingeniería del Centro de la Provincia de Buenos Aires, Facultad de Ingeniería. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires
  • Marcela Bax Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano, Facultad de Ciencias Sociales. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires
  • Ariadna Flores Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano, Facultad de Ciencias Sociales. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires
  • Gustavo G. Politis Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano, Facultad de Ciencias Sociales. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires
  • Luciano Valenzuela Laboratorio de Ecología Evolutiva Humana. Núcleo de Estudios Interdisciplinarios de Poblaciones Humanas de Patagonia Austral, Facultad de Ciencias Sociales. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires

Keywords:

Bone protein, Collagen contamination, FTIR

Abstract

This paper analyzes FTIR (infrared spectroscopy by Fourier transform) spectra of type I collagen samples extracted from modern and archaeological bones of guanaco (Lama guanicoe) and Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) with varying degrees of protein conservation and, in some cases, external organic input. C:N atomic ratio, C%, N%, and collagen yield were determined. Four transmittance ratios from the spectra were analyzed: Amide III/Amide I, Amide III/Proline, Proline/Amide I, 1080 cm-1/Amide I, which we propose be used for determining collagen quality. Since FTIR analysis is very versatile, it can be used as a simple decision-making tool, it is inexpensive, rapid, and available, we argue that establishing quality parameters with this method would allow us to determine collagen preservation in archaeological samples before sending them for isotopic and radiometric analyses and select the best samples.

Downloads

Download data is not yet available.

References

Ambrose, S. H. 1990. Preparation and Characterization of Bone and Tooth Collagen for Isotopic Analysis. Journal of Archaeological Science 17: 431–451. https://doi.org/10.1016/0305-4403(90)90007-R

Belbachir, K., R. Noreen, G. Gouspillou, y C. Petibois. 2009. Collagen types analysis and differentiation by FTIR spectroscopy. Analytical and Bioanalytical Chemistry 395: 829–837. https://doi.org/10.1007/s00216-009-3019-y

D´Elia, M., G. Gianfrate, G. Quarta, L. Giotta, G. Giancane y L. Calcagnile. 2007. Evaluation of possible contamination sources in the 14C analysis of bone samples by FTIR spectroscopy. Radiocarbon 49 (2): 201–210. https://doi.org/10.1017/S0033822200042120

De Niro, M. J. 1985. Postmortem preservation and alteration of in vivo bone collagen isotope ratios in relation to paleodietary reconstruction. Nature 317: 806–809. https://doi.org/10.1038/317806a0

Devièse T., T. W. Stafford, M. R. Waters, C. Wathen, D. Comeskey, L. Becerra-Valdivia y T. Higham. 2018. Increasing accuracy for the radiocarbon dating of sites occupied by the first Americans. Quaternary Science Reviews 198: 171-180. https://doi.org/10.1016/j.quascirev.2018.08.023

Gianfrate, G., M. D’Elia, G. Quarta, L.Giotta, L.Valli y L.Calcagnile. 2007. Qualitative application based on IR spectroscopy for bone sample quality control in radiocarbon dating. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms 259 (1): 316–319. https://doi.org/10.1016/j.nimb.2007.01.309

Gutiérrez, M. A., G. Martínez, H. Luchsinger, S. Grill, A. F. Zucol, G. S. Hassan, M. P. Barros, C. A. Kaufmann y M. C. Álvarez. 2011. Paleoenvironments in the Paso Otero locality during Late Pleistocene–Holocene (Pampean Region, Argentina): an interdisciplinary approach. Quaternary International 245 (1): 37–47. https://doi.org/10.1016/j.quaint.2010.11.010

Lin-Vien, D., N. B. Colthup, W. G. Fateley y J. G. Grasselli. 1991. The Handbook of Infrared and Raman Characteristic Frequencies of Organic Molecules. Academic Press. San Diego.

Longin, R. 1971. New Method of Collagen Extraction for Radiocarbon Dating. Nature 230: 241–242. https://doi.org/10.1038/230241a0

Martínez, G. 2006. Arqueología del curso medio del río Quequén Grande: estado actual y aportes a la arqueología de la región pampeana. Relaciones de la Sociedad Argentina de Antropología 31: 249–275.

Martínez, G. y M. A. Gutiérrez. 2011. Paso Otero 5: a summary of the interdisciplinary lines of evidence for reconstructing early human occupation and paleoenvironment in the Pampean region, Argentina. En Vialou, D. (ed.) Peuplements et Préhistoire de l’Amérique: 271-284. Muséum National d’ Histoire Naturelle. Departement de Prehistoire, U.M.R. Paris.

Metreveli, N. O., K. K. Jariashvili, L. O. Namicheishvili, D. V. Svintradze, E. N. Chikvaidze, A. Sionkowska y J. Skopinska. 2010. Ecotoxicology and Environmental Safety UV–vis and FT-IR spectra of ultraviolet irradiated collagen in the presence of antioxidant ascorbic acid. Ecotoxicology and Environmental Safety 73 (3): 448–455. https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2009.12.005

Politis, G. G. y J. Steele. 2014. Cronología radiocarbónica. En Politis, G., M. A. Gutiérrez y C. Scabuzzo (eds.) Estado actual de las investigaciones en el sitio arqueológico Arroyo Seco 2 (pcia. de Buenos Aires, Argentina): 57-66. Serie Monográfica INCUAPA 5. Olavarría.

Politis, G. G., P. G. Messineo, Th. W. Stafford Jr. y E. L. Lindsey. 2019 a. Campo Laborde: A late Pleistocene giant ground sloth kill and butchering site in the Pampas. Science Advances 5 (3): 4546. https://doi.org/10.1126/sciadv.aau4546

Politis, G. G., D. C León, F. Mari, A. Blasi y P. Vitale. 2019 b. Análisis y datación de los restos faunísticos de la colección Ameghino del sitio Cañada Rocha (pdo. de Luján, pcia. de Buenos Aires ). Intersecciones en Antropología 20 (2): 181-194.

Prockop, D. J. y N. A. Guzmán. 1981. El colágeno. Tiempos Médicos 191: 53–63.

Riaz, T., R. Zeeshan, F. Zarif, K. Ilyas, S. Z. Safi, A. Rahim e I. Ur. 2018. FTIR analysis of natural and synthetic collagen. Applied Spectroscopy Reviews 53 (9): 703–746. https://doi.org/10.1080/05704928.2018.1426595

Rubinos Pérez, A. 2009. Límites de la geocronología en el estudio de yacimientos de época histórica. Munibe (Antropologia-Arkeologia) 60: 331-347.

Stafford, T., K. Brendel y R. C. Duhamel. 1988. Radiocarbon, 13C and 15N analysis of fossil bone: Removal of humates with XAD-2 resin. Geochimica et Cosmochimica Acta 52: 2257-2267. https://doi.org/10.1016/0016-7037(88)90128-7

Van Klinken, J. G. 1999. Bone collagen quality indicators for palaeodietary and radiocarbon measurements. Journal of Archaeological Science 26: 687–695. https://doi.org/10.1006/jasc.1998.0385

Vidal, B. D. C. y M. L. S. Mello. 2011. Collagen type I amide I band infrared spectroscopy. Micron 42 (3): 283–289. https://doi.org/10.1016/j.micron.2010.09.010

Published

30-12-2019

How to Cite

Vitale, P., Tasca, J. ., Bax, M., Ariadna Flores, Politis, G. G. ., & Valenzuela, L. (2019). FTIR Analysis of colagen preservation and possible contamination in Quaternary bones samples from the Pampas. Anales De Arqueología Y Etnología, 74(2), 169–189. Retrieved from https://revistas.uncu.edu.ar/ojs3/index.php/analarqueyetno/article/view/3737

Issue

Section

Dossier