Maize landraces characterization using Generalized Procrustes Analysis and Multiple Factor Analysis

Authors

  • Paola Zuliani Dpto. de Estadística. Facultad de Economía y Administración. Universidad Nacional del Comahue. Buenos Aires 1400. (8300) Neuquén. Argentina
  • Andrea Lavalle Dpto. de Estadística. Facultad de Economía y Administración. Universidad Nacional del Comahue. Buenos Aires 1400. (8300) Neuquén. Argentina
  • Sergio J. Bramardi Dpto. de Estadística. Facultad de Economía y Administración. Universidad Nacional del Comahue. Buenos Aires 1400. (8300) Neuquén. Argentina
  • Raquel Defacio Estación Experimental Agropecuaria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Avenida Frondizi (Ruta 32) km 4,5. (2700) Pergamino. Provincia de Buenos Aires. Argentina

Keywords:

three-way data, genotype*environment interaction, Multiple Factorial Analysis, Generalized Procrustes Analysis

Abstract

El establecimiento de relaciones entre
taxones es un paso esencial en el proceso
de catalogación y evaluación del material
conservado en un Banco de Germoplasma.
Existen distintos métodos de evaluación en
función del tipo de caracteres estudiados.
Cuando el registro de caracteres se repite en el tiempo y en distintos ambientes, se debe separar la variabilidad intrínsecamente genética entre los taxones de aquella que se debe al ambiente, y más aún, de la posible variabilidad debida a la interacción genotipo*ambiente para el posterior establecimiento de relaciones puramente filogenéticas. En el presente trabajo se estudia comparativamente la factibilidad de aplicación de dos estrategias de análisis estadístico para dar solución a este problema. La primera corresponde al análisis tradicional donde se realiza un Análisis de Componentes Principales sobre los caracteres promedios a lo largo de los diferentes ambientes; y la segunda son métodos más complejos en los cuales cada dato es originado por tres modos: individuos, variables y condiciones ambientales, tales como el Análisis Factorial Múltiple y el Análisis de Procrustes Generalizado. Si bien las configuraciones resultantes fueron todas equivalentes, los métodos de tres vías permiten la interpretación de la interacción genotipo*ambiente.

Published

10-11-2022

Issue

Section

Scientific articles